Lecture 7 - Regulatory Circuitry and Networks - MLCB24
Playlist: https://tinyurl.com/MLCBlectures
Notes: https://tinyurl.com/MLCB24notes
Lecture 7 Slides: https://www.dropbox.com/scl/fi/m3lge5...
Lecture 7 Chapter: https://www.dropbox.com/scl/fi/uijmpt...
0:00 Intro to regulatory motifs / gene regulation
6:18 Motifs (generative model) vs. instances (single occurrence)
12:40 Regulatory Genomics Challenges: Motifs - Regulators - Targets
17:40 Enrichment-based motif discovery
20:53 Expectation Maximization for Motif Discovery - starting positions - motif definitions
26:58 Deep Learning and Convolutional Neural Networks for Motif Discovery
32:03 Evolutionary signatures for de novo motif discovery
42:11 Evolutionary signatures for motif instance identification
50:44 Network Analysis Section Overview
51:55 Network types: regulatory, metabolic, signaling, interaction, functional
57:20 Network applications and challenges
1:02:27 Matrix Representation of Networks and Linear Algebra
1:06:03 Eigenvalues, Eigenvectors
1:09:19 Principal Components Analysis PCA, SVD
1:11:58 Non-linear Dimensionality Reduction: t-SNE
1:16:23 Machine Learning on Networks
1:18:49 Summary
Смотрите видео Lecture 7 - Regulatory Circuitry and Networks - MLCB24 онлайн без регистрации, длительностью часов минут секунд в хорошем качестве. Это видео добавил пользователь Manolis Kellis 27 Сентябрь 2024, не забудьте поделиться им ссылкой с друзьями и знакомыми, на нашем сайте его посмотрели 48 раз и оно понравилось 1 людям.