Практическая биоинформатика

Linux1. Как устроены команды в Linux

Python-13. Изменяемые и неизменяемые типы данных в python

Python-11. Как создать функцию в python

Python-6. Типы данных в python: словари

PyNTO4. Как решать задачи на поиск таргетной последовательности при помощи python

Python-7. Типы данных в python: множество

LINUX7. Как редактировать файлы при помощи команды sed

Statistics 1 - введение в статистику. Описательные статистики

NF5. Как устроены каналы в Nextflow, как создавать каналы

Биоинженерия и биоинформатика: разбор задачи финала 2024 по ПЦР и RNAseq (магистры)

Биоинженерия и биоинформатика: разбор задачи финала 2024 по биоинформатике (магистры)

Биоинженерия и биоинформатика: разбор задачи финала 2024 по биохимии (бакалавры)

NF6. Методы для работы с каналами в Nextflow

NF8. Раздел input в процессе Nextflow

Statistics 3 - алгоритм статистического вывода на примере теста Стьюдента. Что такое p-value

NF10. Как соединять процессы в Nextflow при помощи каналов

NF3. Основные типы данных Groovy

NF4. Установка Nextflow

Statistics 5 - ограничения теста Стьюдента. Тест Велча

NF11. Как использовать директивы процессов Nextflow

Statistics 6 - Непараметрические тесты. Тест Манна-Уитни и Вилкоксона

Snakemake 2: дополнительные возможности при написании пайплайнов

MB4. Как подбирать праймеры для ПЦР

Python-9. Как работает цикл for в python

Statistics 2 - статистика вывода. Распределения в статистике

NF2. Как устроен язык для написания пайплайнов Nextflow

LINUX14. Как устанавливать программы при помощи conda

NF1. Что такое пайплайны и зачем они нужны

2 ноября - О Нобелевской премии за исследование эволюции человека методами палеогенетики

Биоинженерия и биоинформатика: разбор задачи финала 2024 по биоинформатике (бакалавры)

NF7. Как устроены процессы в Nextflow

Биоинженерия и биоинформатика: разбор задачи финала 2024 по молекулярной биологии (магистры)

Биоинженерия и биоинформатика: разбор задачи финала 2024 по биохимии (магистры)

Statistics 4 - виды теста Стьюдента. Почему используется двусторонний тест

Биоинженерия и биоинформатика: разбор задачи финала 2024 по молекулярной биологии (бакалавры)

Биоинженерия и биоинформатика: разбор задачи финала 2024 по ПЦР и RNAseq (бакалавры)

NF9. Раздел Output процессов Nextflow

MB6. Как решать задачи на секвенирование по Сэнгеру

PyNTO6. Как создать собственный модуль и пакет в python

RNA-Seq9. Как аннотировать дифференциально экспрессирующиеся гены в iDEP

LINUX6. Как искать информацию в файлах при помощи команды grep

Python-3. Как создать переменную в Python

BM1. Выравнивание последовательностей: алгоритмы Нидлмана-Вунша и Смита-Ватермана.

R4 - векторы в R. Часть 2

BD15. Разбор задачи финала магистров олимпиады Я-профессионал 2021 года

GI6. Как решать задачи на CRISPR/Cas9: дизайн нРНК

RNA-Seq1. Как анализировать данные RNA-seq

MB3. Как решать задачи на ПЦР

LINUX3. Как создавать, копировать и удалять файлы в Linux

Python-4. Типы данных в Python: числа и строки

Linux0. О курсе Linux для биоинформатики. Как установить Linux при помощи VirtualBox