Análise de Dados de
Este é o terceiro vídeo desta série e nele discutimos como alterar o nível de resolução do report de resultados bem como parâmetros de análise dos dados de #ngs que podem ser ajustados pelo usuário na sua rotina.
Entre eles: Comprimento mínimo de leitura, Número máximo de inserções e deleções, número máximo de leituras para genotipagem e etc.
Lembrando que esta é uma série de vídeos sobre análise de Dados de sequenciamento de nova geração para os genes HLA, tendo como foco o software software TypeStream Visual desenvolvido pela One Lambda.
Cynthia Greenfield generosamente partilhou sua grande experiência nas diversas ferramentas que este software possui para auxiliar o analista na investigação e liberação da genotipagem HLA de alta resolução.
O software TypeStream visual é utilizado na etapa de análise de dados de sequenciamento de DNA de nova geração utilizando-se kits de genotipagem HLA AllType NGS.
Os genes HLA são importantes na determinação de compatibilidade de transplantes de órgãos, principalmente nos transplantes de medula óssea. Entretanto, o grande desafio inerente a esta tarefa é a grande variabilidade genética encontrada neste grupo de genes. Atualmente, mais de 30.000 alelos foram descritos.
Para mais informações: https://www.thermofisher.com/onelambda
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