Análise de Dados de
Como e por que excluir regiões genômicas da análise de dados #ngs para #hla?
Discutimos rapidamente sobre este tema no 5° vídeo desta série
e como esta ferramenta pode auxiliar na análise de regiões de difícil caracterização por plataformas #ngs de leituras curtas e na resolução de cenários como a caracterização de alelos novos.
Lembrando que esta é uma série de vídeos sobre análise de Dados de sequenciamento de nova geração para os genes HLA, tendo como foco o software software TypeStream Visual desenvolvido pela One Lambda.
Cynthia Greenfield generosamente partilhou sua grande experiência nas diversas ferramentas que este software possui para auxiliar o analista na investigação e liberação da genotipagem HLA de alta resolução.
O software TypeStream visual é utilizado na etapa de análise de dados de sequenciamento de DNA de nova geração utilizando-se kits de genotipagem HLA AllType NGS.
Os genes HLA são importantes na determinação de compatibilidade de transplantes de órgãos, principalmente nos transplantes de medula óssea. Entretanto, o grande desafio inerente a esta tarefa é a grande variabilidade genética encontrada neste grupo de genes. Atualmente, mais de 30.000 alelos foram descritos.
Para mais informações: https://www.thermofisher.com/onelambda
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